CyanoLyase

Phyletic profiles

This table shows the distribution of phycobilin lyases or related proteins in the different genomes of the CyanoLyase database. Co-occurrence of sequences in sets of genomes sharing similar characteristics can easily be spotted and this tool is therefore useful to predict potential heterodimers. An example of this is the previously undescribed CpcSII/CpcUII pair, which reminds the CpcSI/CpcUI heterodimer, recently characterized in Synechococcus sp. PCC 7002 (Saunée et al. 2008, Shen et al. 2008).

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Phylum Order Species Strain Subcluster Clade Ecotype PBP in rods Habitat Pigment type CpcS family CpcS-I subfamily CpcS-II subfamily CpcS-III subfamily CpcU-I subfamily CpcU-II subfamily CpeS-I subfamily CpeS-II subfamily CpeS-ProHL subfamily CpeU-I subfamily CpeU-II subfamily CpcS homologs family CpcV family CpcT family CpeT family RpcT family T homologs family CpcE/RpcE family CpcE-I subfamily CpcE-II subfamily RpcE subfamily CpcF/RpcF family CpcF-I subfamily CpcF-II subfamily RpcF subfamily PecE family PecF family RpcG family CpeF family MpeU family MpeV family MpeX family CpeY family MpeQ family MpeW family MpeY family MpeZ family CpeZ family IaiH family L8106_11777 homologs family L8106_16949 homologs family L8106_22089 homologs family MC7420_3535 homologs family MC7420_4701 homologs family CotB family CotB homologs 1 family CotB homologs 2 family NblB family
Cyanobacteria Chroococcales Synechococcus sp. CC9311 [fasta] 5.1 I PC+PEI+PEII marine 3dA/CA4-A - - 1 - - 1 - 1 - - 1 - - - 1 1 - - - - 1 - - - 1 - - - - 1 1 - 1 - - 1 1 1 1 - - - - - - 1 - -
Cyanobacteria Chroococcales Synechococcus sp. CC9605 [fasta] 5.1 II PC+PEI+PEII marine 3c - - 1 - - 1 - 1 - - 1 - - - 1 1 - - - - - - - - - - - 1 - 1 - - 1 1 - - - 1 1 - - - - - - 1 - -
Cyanobacteria Chroococcales Synechococcus sp. WH8109 [fasta] 5.1 II PC+PEI+PEII marine 3bB - - 1 - - 1 - 1 - - 1 - - - 1 1 - - - - 1 - - - 1 - - - - 1 - - 1 1 1 - - 1 1 - - - - - - 1 - -
Cyanobacteria Chroococcales Synechococcus sp. WH8102 [fasta] 5.1 III PC+PEI+PEII marine 3c - - 1 - - 1 - 1 - - 1 - - - 1 1 - - - - - - - - - - - 1 - 1 - - 1 1 - - - 1 1 - - - - - - 1 - -
Cyanobacteria Chroococcales Synechococcus sp. CC9902 [fasta] 5.1 IV PC+PEI+PEII marine 3dA/CA4-A - - 1 - - 1 - 1 - - 1 - - - 1 1 - - - - 1 - - - 1 - - - - 1 1 - 1 - - 1 1 1 1 - - - - - - 1 - -
Cyanobacteria Chroococcales Synechococcus sp. BL107 [fasta] 5.1 IV PC+PEI+PEII marine 3dA/CA4-A - - 1 - - 1 - 1 - - 1 - - - 1 1 - - - - - - - - - - - 1 - 1 1 - 1 - - 1 1 1 1 - - - - - - 1 - -
Cyanobacteria Chroococcales Synechococcus sp. WH7803 [fasta] 5.1 V PC+PEI+PEII marine 3a - - 1 - - 1 - 1 - - 1 - - - 1 1 - - - - 1 - - - 1 - - - 1 - - - 1 - - 1 - 1 1 - - - - - - 1 - -
Cyanobacteria Chroococcales Synechococcus sp. WH7805 [fasta] 5.1 VI PC+PEI marine 2 - - 1 - - 1 - 1 - - 1 - - 1 1 - - 1 - - - 1 - - - - - - 1 - - - 1 - - - - 1 1 - - - - - - 1 - -
Cyanobacteria Chroococcales Synechococcus sp. RS9917 [fasta] 5.1 VIII PC marine 1 - - 1 - - 1 - - - - - - - 1 - - - - - 1 - - - 1 - - - - - - - - - - - - - - 1 - - - - - - 1 - -
Cyanobacteria Chroococcales Synechococcus sp. RS9916 [fasta] 5.1 IX PC+PEI+PEII marine 3dA/CA4-A - - 1 - - 1 - 1 - - 1 - - 1 1 1 - - - - - - - - - - - 1 - 1 1 - 1 - - 1 1 1 1 - - - - - - 1 - -
Cyanobacteria Chroococcales Synechococcus sp. WH5701 [fasta] 5.2 PC marine 1 - - 1 - - 1 - - - - - - - 1 - - - - - 1 - - - 1 - - - - - - - - - - - - - - 1 - - - - - - 1 - -
Cyanobacteria Chroococcales Synechococcus sp. RCC307 [fasta] 5.3 5.3-I PC+PEI+PEII marine 3eA - - 1 - - 1 - 1 - - 1 - - 1 1 - - 1 - - - 1 - - - - - - - 1 1 - 1 - - 1 1 1 1 - - - - - - 1 - -
Cyanobacteria Chroococcales Synechococcus sp. CB0101 [fasta] 5.2 CB4 PC marine 1 - - 1 - - 1 - - - - - - - 1 - - - - - 1 - - - 1 - - - - - - - - - - - - - - 1 - - - - - - 1 - -
Cyanobacteria Chroococcales Synechococcus sp. CB0205 [fasta] 5.2 CB5 PC+PEI marine 2 - - 1 - - 1 - 1 - - 1 - - 1 1 - - - - 1 - - - 1 - - - - 1 - - - 1 - - - - 1 1 - - - - - - 1 - -
Cyanobacteria Chroococcales Synechococcus sp. PCC7335 [fasta] 4 PC+PEI marine CA3 - 1 - - - - 1 - - 1 - 1 1 1 1 - 1 1 - - - 1 - - - - - - 2 - - - 1 - - - - 1 1 - 1 - - - 1 - 1 1
Cyanobacteria Chroococcales Synechococcus sp. PCC7002 [fasta] 3 PC marine halotolerant 1 - 1 - - 1 - - - - - - - 1 1 - - - - 1 - - - 1 - - - - - - - - - - - - - - - 1 - 1 - - - - - 1 1
Cyanobacteria Chroococcales Cyanobium sp. PCC7001 [fasta] Cbm 2 PC marine 1 - - 1 - - 1 - - - - - - - 1 - - - - - 1 - - - 1 - - - - - - - - - - - - - - 1 - - - - - - 1 - -
Cyanobacteria Chroococcales Synechococcus sp. WH8016 [fasta] 5.1 I PC+PEI+PEII marine 3aA - - 1 - - 1 - 1 - - 1 - - - 1 1 - - - - 1 - - - 1 - - - 1 - - - 1 - - 1 - 1 1 - - - - - - 1 - -
Cyanobacteria Chroococcales Prochlorococcus marinus MED4 [fasta] (CCMP1986/CCMP1378) Pro HLI beta-PEIII marine low b/a - - - - - - - - 1 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1 - - - - - - - - -
Cyanobacteria Chroococcales Prochlorococcus marinus MIT9515 [fasta] Pro HLI beta-PEIII marine low b/a - - - - - - - - 1 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1 - - - - - - - - -
Cyanobacteria Chroococcales Prochlorococcus marinus MIT9301 [fasta] Pro HLII beta-PEIII marine low b/a - - - - - - - - 1 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1 - - - - - - - - -
Cyanobacteria Chroococcales Prochlorococcus marinus AS9601 [fasta] Pro HLII beta-PEIII marine low b/a - - - - - - - - 1 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1 - - - - - - - - -
Cyanobacteria Chroococcales Prochlorococcus marinus MIT9215 [fasta] Pro HLII beta-PEIII marine low b/a - - - - - - - - 1 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1 - - - - - - - - -
Cyanobacteria Chroococcales Prochlorococcus marinus MIT9312 [fasta] Pro HLII beta-PEIII marine low b/a - - - - - - - - 1 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1 - - - - - - - - -
Cyanobacteria Chroococcales Prochlorococcus marinus MIT9202 [fasta] Pro HLII beta-PEIII marine low b/a - - - - - - - - 1 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1 - - - - - - - - -
Cyanobacteria Chroococcales Prochlorococcus marinus NATL1A [fasta] Pro LLI PEIII marine high b/a - - - - - - - 1 - - - - - - 1 - - - - - - - - - - - - - - - - 1 1 - - - - 1 1 - - - - - - - - -
Cyanobacteria Chroococcales Prochlorococcus marinus NATL2A [fasta] Pro LLI PEIII marine high b/a - - - - - - - 1 - - - - - - 1 - - - - - - - - - - - - - - - - 1 1 - - - - 1 1 - - - - - - - - -
Cyanobacteria Chroococcales Prochlorococcus marinus SS120 [fasta] (CCMP1375) Pro LLII PEIII marine high b/a - - - - - - - 1 - - - - - - 1 - - - - - - - - - - - - - - - - 1 1 - - - - 1 1 - - - - - - - - -
Cyanobacteria Chroococcales Prochlorococcus marinus MIT9211 [fasta] Pro LLIII PEIII marine High b/a - - - - - - - 1 - - - - - - 1 - - - - - - - - - - - - - - - - 1 1 - - - - 1 1 - - - - - - - - -
Cyanobacteria Chroococcales Prochlorococcus marinus UH18301 [fasta] Pro HLII beta-PEIII marine low b/a - - - - - - - - 1 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1 - - - - - - - - -
Cyanobacteria Chroococcales Prochlorococcus sp. MIT9303 [fasta] Pro LLIV PEIII marine high b/a - - - - - - - 1 - - - - - - 1 - - - - - - - - - - - - - - - - 1 1 - - - - 1 1 - - - - - - - - -
Cyanobacteria Chroococcales Prochlorococcus sp. MIT9313 [fasta] Pro LLIV PEIII marine high b/a - - - - - - - 1 - - - - - - 1 - - - - - - - - - - - - - - - - 1 1 - - - - 1 1 - - - - - - - - -
Cyanobacteria Chroococcales Synechocystis sp. PCC6803 [fasta] (ATCC27184) PC freshwater 1 - 1 - - 1 - - - - - - - - 1 - - - - 1 - - - 1 - - - - - - - - - - - - - - - 1 - - - - - - - 1 1
Cyanobacteria Chroococcales Acaryochloris marina MBIC11017 [fasta] (AM1) PC marine 1 2 - - - 1 - - - - - - - - 1 - - - - 1 - - - 1 - - - - - - - - - - - - - - - 1 - 1 - - - - - 1 -
Cyanobacteria Nostocales Anabaena (Nostoc) sp. PCC7120 [fasta] PC+PEC freshwater - - - 1 - - - - - - - - 1 1 - - 1 - 1 - - - 1 - - 1 1 - - - - - - - - - - - 1 - 1 1 4 - - - 1 1
Cyanobacteria Nostocales Anabaena variabilis ATCC29413 [fasta] (PCC7937) PC+PEC freshwater - - - 1 - - - - - - - - 1 1 - - 1 - 1 - - - 1 - - 1 1 - - - - - - - - - - - 1 - 1 1 1 - - - 1 1
Cyanobacteria Nostocales Anabaena (Nostoc) azollae 0708 [fasta] PC+PEC intracellular - - - 1 - - - - - - - - 1 1 - - - - 1 - - - 1 - - 1 1 - - - - - - - - - - - 1 - - 1 - - - - - 1
Cyanobacteria Oscillatoriales Arthrospira (Spirulina) maxima CS-328 [fasta] PC freshwater 1 - 1 - - 1 - - - - - - - - 1 - - - - 1 - - - 1 - - - - - - - - - - - - - - - 1 1 1 1 2 - - - 1 1
Cyanobacteria Chroococcales Crocosphaera watsonii WH8501 [fasta] PC+PEI marine - 1 - - 1 - 1 - - - - - - 1 2 - - - 1 - - - 1 - - - - 1 1 - - - 2 - - - - 2 1 - 1 1 - - 1 - 1 1
Cyanobacteria Chroococcales Cyanothece sp. ATCC51142 [fasta] PC marine 1 - 1 - - 1 - - - - - - - - 1 - - - - 1 - - - 1 - - - - - - - - - - - - - - - 1 - 1 1 - - - - 1 1
Cyanobacteria Chroococcales Cyanothece sp. PCC7424 [fasta] PC+PEI freshwater 2 - 1 - - 1 - 1 - - 1 - 1 1 1 1 - 1 - 1 - - - 1 - - - - - 1 - - - 1 - - - - 1 1 - 1 - 2 - 2 - 1 1
Cyanobacteria Chroococcales Cyanothece sp. PCC7425 [fasta] PC freshwater 1 - - - 1 - - - - - - - - - 1 - - - - 1 - - - 1 - - - - - - - - - - - - - - - 1 - - - - - 1 1 1 1
Cyanobacteria Chroococcales Cyanothece sp. PCC8801 [fasta] PC+PEI freshwater 2 - 1 - - 1 - 1 - - 1 - - 1 1 1 - - - 1 - - - 1 - - - - - 1 - - - 1 - - - - 1 1 - 1 1 1 - - - 1 1
Cyanobacteria Chroococcales Cyanothece sp. PCC8802 [fasta] PC freshwater 1 - 1 - - 1 - - - - - - - 1 1 - - - - 1 - - - 1 - - - - - - - - - - - - - - - 1 - 1 1 - - - - 1 1
Cyanobacteria Chroococcales Cyanothece sp. CCY0110 [fasta] PC marine 1 - 1 - - 1 - - - - - - - - 1 - - - - - - - - 1 - - - - - - - - - - - - - - - 1 - 1 1 - - - - - 1
Cyanobacteria Chroococcales Cyanothece sp. PCC7822 [fasta] PC+PEI freshwater 2 - 1 - - 1 - 1 - - 1 - 1 1 1 1 - 1 - 1 - - - 1 - - - - - 1 - - - 1 - - - - 1 1 - 1 1 1 1 2 - 1 1
Cyanobacteria Nostocales Fremyella diplosiphon (Tolypothrix sp. / Calothrix sp.) Fd33 [fasta] (UTEX481/PCC7601) PC+PEI freshwater CA3 - - - - - - 1 - - 1 - - - - 1 - - - 2 - - - 1 - - - - - 1 - - - 1 - - - - 1 - - - - - - 1 - - -
Cyanobacteria Stigonematales Fischerella sp. (Mastigocladus laminosus) JSC-11 [fasta] PC+PEC freshwater - - - 1 - - - - - - - - 1 1 - - 1 - 1 - - - 1 - - 1 1 - - - - - - - - - - - 1 - 1 1 - - - - 1 1
Cyanobacteria Chroococcales Gloeobacter violaceus PCC7421 [fasta] PC+PEI Rock 2 - 1 - - 1 - 1 - - 1 - 1 1 1 1 - 1 - 1 - - - 1 - - - - - 1 - - - 1 - - - - 1 1 - - - - - 1 - 2 1
Cyanobacteria Chroococcales Gloeothece sp. PCC6909/1 [fasta] PC+PEI freshwater 2 - 1 - - 1 - 1 - - 1 - 1 1 1 1 - 1 - 1 - - - 1 - - - - - 1 - - - 1 - - - - 1 1 - 1 1 - - 2 - 1 1
Cyanobacteria Oscillatoriales Lyngbya aestuarii CCY9616 [fasta] (PCC8106/CCY8106) PC marine 1 - 1 - - 1 - - - - - - 1 1 1 - - 1 - 1 - - - 1 - - - - - - - - - - - - - - - 1 1 1 1 1 - - - 1 1
Cyanobacteria Oscillatoriales Microcoleus chthonoplastes PCC7420 [fasta] PC+PEC halotolerant - - - 1 - - - - - - - - - 1 - - - - 1 - - - 1 - - 1 1 - - - - - - - - - - - 1 - 1 1 6 2 - - 1 1
Cyanobacteria Chroococcales Microcystis aeruginosa NIES-843 [fasta] PC freshwater 1 - 1 - - 1 - - - - - - 1 1 1 - - 1 - 1 - - - 1 - - - - - - - - - - - - - - - 1 - 1 1 1 - - - 1 1
Cyanobacteria Nostocales Nodularia spumigena CCY9414 [fasta] PC marine 1 - - - 1 - - - - - - - - 1 1 - - 1 - 1 - - - 1 - - - - - - - - - - - - - - - 1 - 1 1 2 - - - 1 1
Cyanobacteria Nostocales Nostoc punctiforme ATCC29133 [fasta] (PCC73102) PC+PEI Soil 2 - 1 - - 1 - 1 - - 1 - - 1 1 1 - 1 - 1 - - - 1 - - - - - 1 - - - 1 - - - - 1 1 - 1 1 - - 1 - 1 1
Cyanobacteria Chroococcales Synechococcus elongatus PCC7942 [fasta] 1.1 PC freshwater 1 - 1 - - 1 - - - - - - 1 1 1 - - 1 - 1 - - - 1 - - - - - - - - - - - - - - - 1 - - - - - - 1 1 1
Cyanobacteria Chroococcales Synechococcus elongatus PCC6301 [fasta] (ATCC 27144) 1.1 PC freshwater 1 - 1 - - 1 - - - - - - 1 1 1 - - 1 - 1 - - - 1 - - - - - - - - - - - - - - - 1 - - - - - - 1 1 1
Cyanobacteria Chroococcales Synechococcus sp. JA-2-3B'a(2-13) [fasta] PC Hot spring 1 - - - 1 - - - - - - - 1 - 2 - - 1 - 2 - - - 1 - - - - - - - - - - - - - - - 1 - - - - - - - 1 1
Cyanobacteria Chroococcales Synechococcus sp. JA-3-3Ab [fasta] PC Hot spring 1 - - - 1 - - - - - - - 1 - 2 - - 1 - 2 - - - 1 - - - - - - - - - - - - - - - 1 - - - - - - - 1 1
Cyanobacteria Chroococcales Thermosynechococcus elongatus BP-1 [fasta] PC Hot spring 1 - - - 1 - - - - - - - - - 1 - - - - 1 - - - 1 - - - - - - - - - - - - - - - 1 - - - - - - - 1 1
Cyanobacteria Oscillatoriales Trichodesmium erythraeum IMS101 [fasta] PC+PEI marine - 1 - - 1 - 1 - - 1 - - - 1 1 - - - 1 - - - 1 - - - - - 2 - - - 1 - - - - 2 1 - 1 1 2 - 1 - 1 1
Rhodophyta Cyanidioschyzon merolae 10D [fasta] PC thermophile 1 1 - - - - - - - - - - - - 1 - - - - 1 - - - 1 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2 -
Cryptophyta Pyrenomonadales Guillardia theta CCMP2712 [fasta] Cr-PE 545 marine n.a. - - - - - - - - - - - - - 1 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1 - - - - - - - - - -
Cyanobacteria Chroococcales Microcystis aeruginosa PCC7806 [fasta] PC freshwater, soil 1 - 1 - - 1 - - - - - - 1 1 1 - - 1 - 1 - - - 1 - - - - - - - - - - - - - - - 1 - 1 2 2 - - - 1 1
Cyanobacteria Oscillatoriales Arthrospira (Spirulina) platensis NIES-39 [fasta] PC freshwater 1 - 1 - - 1 - - - - - - - - 1 - - - - 1 - - - 1 - - - - - - - - - - - - - - - 1 1 1 1 2 - - - 1 1
Cyanobacteria Oscillatoriales Microcoleus vaginatus FGP-2 [fasta] PC desert soil crust 1 - 1 - - 1 - - - - - - - - 1 - - 1 - 1 - - - 1 - - - - - - - - - - - - - - - 1 - 1 1 2 1 1 - 1 1
Cyanobacteria Oscillatoriales Lyngbya majuscula 3L [fasta] PC+PEI marine 2 - 1 - - 1 - 1 - - 1 - 1 - 1 1 - - - 1 - - - 1 - - - - - 1 - - - 1 - - - - 1 1 - 1 1 6 - 1 - 1 1
Cyanobacteria Oscillatoriales Oscillatoria sp. PCC6506 [fasta] (PCC9029/ATCC29081 /UTEX 1547) PC unknown 1 - 1 - - 1 - 1 - - - - - - 1 - - 1 - 1 - - - 1 - - - - - - - - - - - - - - - 1 - 1 1 2 - - - 2 1
Cyanobacteria Nostocales Cylindrospermopsis raciborskii CS-505 [fasta] PC freshwater 1 - - - 1 - - - - - - - - 1 1 - - - - 1 - - - 1 - - - - - - - - - - - - - - - 1 - - - - - - - 1 1
Cyanobacteria Nostocales Raphidiopsis brookii D9 [fasta] PC freshwater 1 - - - 1 - - - - - - - - 1 1 - - - - 1 - - - 1 - - - - - - - - - - - - - - - 1 - - - - - - - 1 1
Rhizaria Cercozoa Paulinella chromatophora M0880 [fasta] PC endosymbiont of amoeba 1 - - 1 - - 1 - - - - - - - 1 - - - - 1 - - - 1 - - - - - - - - - - - - - - - 1 - - - - - - - - -
Cyanobacteria Chroococcales Cyanothece sp. ATCC51472 [fasta] PC marine 1 - 1 - - 1 - - - - - - - - 1 - - - - 1 - - - 1 - - - - - - - - - - - - - - - 1 - 1 1 - - - - 1 1
Cyanobacteria Chroococcales Acaryochloris sp. CCMEE5410 [fasta] APC only salted lake - 1 - - 1 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1 - 1 - - - - - 1 -
Cyanobacteria Oscillatoriales Arthrospira (Spirulina) platensis Paraca [fasta] PC freshwater 1 - 1 - - 1 - - - - - - - - 1 - - - - 1 - - - 1 - - - - - - - - - - - - - - - 1 1 1 1 - - - - 1 1
Cryptophyta Cryptomonadales Hemiselmis andersenii CCMP644 [fasta] Cr-PE 555 marine n.a. - - - - - - - - - - - - - 1 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cyanobacteria Chroococcales Crocosphaera watsonii WH0003 [fasta] PC+PEI marine - 1 - - 1 - 1 - - - - - - 1 1 - - - 1 - - - 1 - - - - - 1 - - - 1 - - - - 2 1 - 1 - - - 1 - 1 1
Cyanobacteria Chroococcales Microcystis aeruginosa PCC9701 [fasta] PC freshwater 1 - 1 - - 1 - - - - - - 1 1 1 - - 1 - 1 - - - 1 - - - - - - - - - - - - - - - 1 - 1 1 - - - - 1 1
Cyanobacteria Chroococcales Microcystis aeruginosa PCC9808 [fasta] PC freshwater 1 - 1 - - 1 - - - - - - 1 1 1 - - 1 - 1 - - - 1 - - - - - - - - - - - - - - - 1 - 1 1 - - - - 1 1
Cyanobacteria Chroococcales Microcystis aeruginosa PCC7941 [fasta] PC freshwater 1 - 1 - - 1 - - - - - - 1 1 1 - - 1 - 1 - - - 1 - - - - - - - - - - - - - - - 1 - 1 1 - - - - 1 1
Cyanobacteria Chroococcales Microcystis aeruginosa PCC9443 [fasta] PC freshwater 1 - 1 - - 1 - - - - - - 1 1 1 - - 1 - 1 - - - 1 - - - - - - - - - - - - - - - 1 - 1 1 - - - - 1 1
Cyanobacteria Chroococcales Microcystis aeruginosa PCC9717 [fasta] PC freshwater 1 - 1 - - 1 - - - - - - 1 1 1 - - 1 - 1 - - - 1 - - - - - - - - - - - - - - - 1 - 1 1 - - - - 1 1
Cyanobacteria Chroococcales Microcystis aeruginosa PCC9432 [fasta] PC freshwater 1 - 1 - - 1 - - - - - - 1 1 1 - - 1 - 1 - - - 1 - - - - - - - - - - - - - - - 1 - 1 1 - - - - 1 1
Cyanobacteria Chroococcales Microcystis sp. T1-4 [fasta] PC+PEI freshwater 2 - 1 - - 1 - 1 - - 1 - 1 1 1 1 - 1 - 1 - - - 1 - - - - - 1 - - - 1 - - - - 1 1 - 1 1 - - - - 1 1
Cyanobacteria Chroococcales Synechococcus sp. WH8020 [fasta] 5.1 I PC+PEI+PEII marine 3dA/CA4-A - - 1 - - - - 1 - - 1 - - - - 1 - - - - 1 - - - 1 - - - - 1 1 - 1 - - - - 1 - - - - - - - - - -
Cyanobacteria Oscillatoriales Oscillatoria nigro-viridis PCC7112 [fasta] PC+PEI soil in orchid house 2 - 1 - - 1 - 1 - - 1 - - - 1 1 - 1 - 1 - - - 1 - - - - - 1 - - - 1 - - - - 1 1 - 1 1 - 1 2 - 1 1
Cyanobacteria Nostocales Scytonema hofmanni PCC7110 [fasta] PC+PEC limestone - - - 1 - - - - - - - - 1 1 - - 1 - 1 - - - 1 - - 1 1 - - - - - - - - - - - 1 - 1 1 - - - - 1 1
Cyanobacteria Stigonematales Fischerella muscicola PCC73103 [fasta] (SAG 1427-1) PC+PEC Soil, rice field - - - 1 - - - - - - - - 1 1 - - 1 - 1 - - - 1 - - 1 1 - - - - - - - - - - - 1 - 1 1 - - - - 1 1
Cyanobacteria Stigonematales Fischerella muscicola PCC7414 [fasta] PC+PEC hot spring - - - 1 - - - - - - - - 1 1 - - 1 - 1 - - - 1 - - 1 1 - - - - - - - - - - - 1 - 1 1 - - - - 1 1
Cyanobacteriales Stigonematales Fischerella thermalis PCC7521 [fasta] PC+PEC hot spring - - - 1 - - - - - - - - 1 1 - - 1 - 1 - - - 1 - - 1 1 - - - - - - - - - - - 1 - 1 1 - - - - 1 1
Cyanobacteria Stigonematales Chlorogloeopsis sp. PCC9212 [fasta] PC+PEC thermal spring - - - 1 - - - - - - - - 1 1 - - 1 - 1 - - - 1 - - 1 1 - - - - - - - - - - - 1 - 1 1 - - - - 1 1
Cyanobacteria Stigonematales Chlorogloeopsis fritschii PCC6912 [fasta] PC+PEC soil - - - 1 - - - - - - - - 1 1 - - 1 - 1 - - - 1 - - 1 1 - - - - - - - - - - - 1 - 1 1 - - - - 1 1
Cyanobacteria Nostocales Calothrix sp. PCC6303 [fasta] PC+PEI freshwater 2 - 1 - - 1 - 1 - - 1 - - 1 1 1 - 1 - 1 - - - 1 - - - - - 2 - - - 2 - - - - 1 1 - - 1 - - 1 - 1 1
Cyanobacteria Nostocales Calothrix sp. PCC7507 [fasta] PC+PEC sphagnum bog - - - 1 - - - - - - - - 1 1 - - 1 - 1 - - - 1 - - 1 1 - - - - - - - - - - - 1 - 1 1 - - - - 1 1
Cynaobacteria Oscillatorialles Oscillatoria sp. PCC10802 [fasta] PC+PEI unknown (Thailand) - 1 - - 1 - 1 - - 1 - 1 1 1 1 - 1 - 1 - - - 1 - - - - - - - - - 1 - - - - 1 1 - 1 1 - 1 1 - 1 1
Cyanobacteria Oscillatorialles Oscillatoria acuminata PCC6304 [fasta] (SAG 1449-3) PC unknown - 1 - - 1 - - - - - - - 1 1 - - 1 - 1 - - - 1 - - - - - - - - - - - - - - - 1 - 1 - - - - - 1 1
Cyanobacteria Stigonematales Fischerella sp. PCC9605 [fasta] PC+PEC Limestone with cryptoendolithic growth - - - 1 - - - - - - - - 1 1 - - 1 - 1 - - - 1 - - 1 1 - - - - - - - - - - - 1 - 1 1 - - - - 1 1
Cyanobacteria Stigonematales Fischerella sp. PCC9431 [fasta] PC+PEC unknown - - - 1 - - - - - - - - 1 1 - - 1 - 1 - - - 1 - - 1 1 - - - - - - - - - - - 1 - 1 1 - - - - 1 1
Cyanobacteria Stigonematales Fischerella sp. PCC9339 [fasta] PC+PEC - - - 1 - - - - - - - - 1 1 - - 1 - 1 - - - 1 - - 1 1 - - - - - - - - - - - 1 - 1 1 - - - - 1 1
Cyanobacteria Nostocales Nostoc sp. PCC7524 [fasta] PC+PEC moderate hot spring - - - 1 - - - - - - - - 1 1 - - 1 - 1 - - - 1 - - 1 1 - - - - - - - - - - - 1 - 1 1 - - - - 1 1
Cyanobacteria Nostocales Nostoc sp. PCC7107 [fasta] PC+PEC shallow pond (saline?) - - - 1 - - - - - - - - 1 1 - - 1 - 1 - - - 1 - - 1 1 - - - - - - - - - - - 1 - 1 1 - - - - 1 1
Cyanobacteria Nostocales Cylindrospermum stagnale PCC7417 [fasta] PC+PEC soil (greenhouse) - - - 1 - - - - - - - - 1 1 - - 1 - 1 - - - 1 - - 1 1 - - - - - - - - - - - 1 - - 1 - - - - 1 1
Cyanobacteria Nostocales Anabaena cylindrica PCC7122 [fasta] PC+PEC freshwater pond - - - 1 - - - - - - - - 1 1 - - 1 - 1 - - - 1 - - 1 1 - - - - - - - - - - - 1 - - 1 - - - - 1 1
Cyanobacteria Nostocales Anabaena sp. PCC7108 [fasta] PC+PEC intertidal zone - - - 1 - - - - - - - - 1 1 - - 1 - 1 - - - 1 - - 1 1 - - - - - - - - - - - 1 - - 1 - - - - 1 1
Cyanobacteria Nostocales Rivularia sp. PCC7116 [fasta] PC+PEC unknown - - - 1 - - - - - - - - 1 1 - - 1 - 1 - - - 1 - - 1 1 - - - - - - - - - - - 1 - 1 1 - - - - 1 1
Cyanobacteria Chroococcales Synechocystis sp. PCC7509 [fasta] PC rock - - - 1 - - - - - - - - 1 1 - - - - 1 - - - 1 - - - - - - - - - - - - - - - 1 - 1 - - - - - 1 1
Cyanobacteria Chroococcales Gloeocapsa sp. PCC7428 [fasta] PC moderate hot spring - - - 1 - - - - - - - - 1 1 - - 1 - 1 - - - 1 - - - - - - - - - - - - - - - 1 - 1 - - - - - 1 1
Cyanobacteria Pleurocapsales Chroococcidiopsis thermalis PCC7203 [fasta] PC+PEC soil - - - 1 - - - - - - - - 1 1 - - 1 - 1 - - - 1 - - 1 1 - - - - - - - - - - - 1 - 1 - - - - - 1 1
Cyanobacteria Chroococcales Dactylococcopsis salina PCC8305 [fasta] saline lake - 1 - - 1 - - - - - - 1 1 1 - - 1 - 1 - - - 1 - - - - - - - - - - - - - - - 1 - - - - - - - - 1
Cyanobacteria Chroococcales Halothece sp. PCC7418 [fasta] PC saline lake - 1 - - 1 - - - - - - 1 1 1 - - 1 - 1 - - - 1 - - - - - - - - - - - - - - - 1 - - - - - - - - 1
Cyanobacteria Pleurocapsales Pleurocapsa sp. PCC7327 [fasta] PC+PEI hot Spring - 1 - - - - 1 - - 2 - 1 1 1 1 - 1 - 1 - - - 1 - - - - - 1 - - - 1 - - - - 1 1 - 1 1 - - 1 - 1 1
Cyanobacteriales Chroococcales Gloeocapsa sp. PCC73106 [fasta] PC+PEI sphagnum bog - 1 - - 1 - 1 - - 1 - 1 1 1 1 - 1 - 1 - - - 1 - - - - - 1 - - - 1 - - - - 1 1 - - - - - - - 1 1
Cyanobacteria Oscillatoriales Leptolyngbya sp. PCC7376 [fasta] PC+PEI marine - 1 - - 1 - 1 - - 1 - - 1 1 1 - - - 1 - - - 1 - - - - - 1 - - - 1 - - - - 1 1 - 1 - - - - - 1 1
Cyanobacteria Chroococcales Cyanobacterium stanieri PCC7202 [fasta] PC alkaline pond - 1 - - 1 - - - - - - - - 1 - - - - 1 - - - 1 - - - - - - - - - - - - - - - 1 - - - - - - - 1 1
Cyanobacteria Chroococcales Cyanobacterium aponimum PCC10605 [fasta] - 1 - - 1 - - - - - - - - 1 - - - - 1 - - - 1 - - - - - - - - - - - - - - - 1 - - - - - - - 1 1
Cyanobacteria Pleurocapsales Stanieria cyanosphaera PCC7437 [fasta] PC+PEI freshwater (pool) - 1 - - 1 - 1 - - 1 - 1 1 1 1 - 1 - 1 - - - 1 - - - - - 1 - - - 1 - - - - 1 1 - - - - - 1 - 1 1
Cyanobacteria Pleurocapsales Xenococcus sp. PCC7305 [fasta] PC+PEI marine - 1 - - 1 - 1 - - 1 - - 1 1 1 - - - 1 - - - 1 - - - - - 1 - - - 1 - - - - 1 1 - 1 - - - 1 - 1 1
Cyanobacteria Oscillatoriales Microcoleus sp. PCC7113 [fasta] PC+PEI soil, orchid house 2 - 1 - 1 - - 1 - - 1 - - 1 1 1 - 1 - 1 - - - 1 - - - - - 1 - - - 1 - - - - 1 1 - 1 - - - 1 - 1 1
Cyanobacteria Oscillatoriales Crinalium epipsammum PCC9333 [fasta] PC sandy crust - - - 1 - - - - - - - - - 1 - - 1 - 1 - - - 1 - - - - - - - - - - - - - - - 1 - 1 - - - - - 1 1
Cyanobacteria Chroococcales Chamaesiphon minutus PCC6605 [fasta] PC+PEI freshwater - 1 - - 1 - 1 - - 1 - - 1 1 1 - - - 1 - - - 1 - - - - - 1 - - - 1 - - - - 1 1 - 1 - - - - - 1 1
Cyanobacteria Chroococcales Cyanobium gracile PCC6307 [fasta] PC freshwater (lake) - - 1 - - 1 - - - - - - - 1 - - - - - 1 - - - 1 - - - - - - - - - - - - - - 1 - - - - - - 1 - -
Cyanobacteria Oscillatoriales Leptolyngbya sp. PCC6406 [fasta] PC+PEC freshwater - 1 - - 1 - - - - - - 1 1 1 - - 1 - 1 - - - 1 - - 1 1 - - - - - - - - - - - 1 - - - - - - - 1 1
Cyanobacteria Oscillatoriales Leptolyngbya sp. PCC7375 [fasta] PC+PEI marine? 2 - 1 - - 1 - 1 - - 1 - 1 1 1 1 - - - 1 - - - 1 - - - - - 1 - - - 1 - - - - 1 1 - - - - - - - 1 1
Cyanobacteria Oscillatoriales Geitlerinema sp. PCC7407 [fasta] PC unknown - - - 1 - - - - - - - - 1 1 - - 1 - 1 - - - 1 - - - - - - - - - - - - - - - 1 - - 1 - - - - 1 1
Cyanobacteria Oscillatoriales Leptolyngbya boryana PCC6306 [fasta] PC freshwater - 1 - - - - - - - - - - 1 1 - - 1 - 1 - - - 1 - - - - - - - - - - - - - - - 1 - 1 1 - - - - 1 1
Cyanobacteria Chroococcales Synechococcus sp. PCC6312 [fasta] PC freshwater - - - 1 - - - - - - - - - 1 - - 1 - 1 - - - 1 - - - - - - - - - - - - - - - 1 - - - - - - - 1 1
Cyanobacteria Chroococcales Synechococcus sp. PCC7502 [fasta] PC sphagnum bog - - - 1 - - - - - - - - - 1 - - 1 - 1 - - - 1 - - - - - - - - - - - - - - - 1 - - - - - - - 1 1
Cyanobacteria Oscillatoriales Pseudanabaena sp. (biceps) PCC7429 [fasta] PC sphagnum bog - 1 - - - - 1 - - - - - - 1 - - 1 - 1 - - - 1 - - - - - - - - - - - - - - - 1 - - - - - - - 1 1
Cyanobacteria Oscillatoriales Pseudanabaena sp. PCC7367 [fasta] PC+PEI Snail shell. Intertidal zone - 1 - - 1 - 1 - - 1 - 1 1 1 1 - 1 - 2 - - - 1 - - - - - 1 - - - 1 - - - - 1 1 - 1 - - - - - 1 1
Cyanobacteria Chroococcales Microcystis aeruginosa TAIHU98 [fasta] PC freshwater 1 - 1 - - 1 - - - - - - 1 1 1 - - 1 - 1 - - - 1 - - - - - - - - - - - - - - - 1 - 1 1 - - - - 1 1

Model strain Model strains, Marine strains

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